Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Cxcl5P50228 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Cxcl5P50228 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Cxcl5P50228 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Cxcl5P50228 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Cxcl5P50228 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Cxcl5P50228 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cxcl5P50228 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
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