Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CebpbP28033 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CebpbP28033 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms