Protein–RNA interactions for Protein: P09023

Hoxb6, Homeobox protein Hox-B6, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb6P09023 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxb6P09023 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms