Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Ccl20O89093 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
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Ccl20O89093 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Ccl20O89093 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Ccl20O89093 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Ccl20O89093 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Ccl20O89093 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Ccl20O89093 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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Ccl20O89093 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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Ccl20O89093 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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Ccl20O89093 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
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Ccl20O89093 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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Ccl20O89093 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Ccl20O89093 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
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