Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kif28pD3YXS5 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms