Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lcn6A2AJB9 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lcn6A2AJB9 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms