Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms