Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

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Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Prdm16A2A935 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prdm16A2A935 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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Prdm16A2A935 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prdm16A2A935 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm16A2A935 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm16A2A935 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm16A2A935 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm16A2A935 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm16A2A935 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm16A2A935 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Prdm16A2A935 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm16A2A935 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Prdm16A2A935 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm16A2A935 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Prdm16A2A935 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm16A2A935 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm16A2A935 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Prdm16A2A935 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm16A2A935 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prdm16A2A935 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Prdm16A2A935 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Prdm16A2A935 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Prdm16A2A935 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm16A2A935 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm16A2A935 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm16A2A935 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm16A2A935 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prdm16A2A935 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm16A2A935 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm16A2A935 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm16A2A935 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm16A2A935 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm16A2A935 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm16A2A935 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm16A2A935 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm16A2A935 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm16A2A935 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prdm16A2A935 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Prdm16A2A935 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms