Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmigd1Q9D7L8 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmigd1Q9D7L8 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmigd1Q9D7L8 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmigd1Q9D7L8 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmigd1Q9D7L8 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmigd1Q9D7L8 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmigd1Q9D7L8 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmigd1Q9D7L8 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmigd1Q9D7L8 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmigd1Q9D7L8 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmigd1Q9D7L8 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmigd1Q9D7L8 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmigd1Q9D7L8 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmigd1Q9D7L8 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmigd1Q9D7L8 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmigd1Q9D7L8 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmigd1Q9D7L8 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmigd1Q9D7L8 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmigd1Q9D7L8 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmigd1Q9D7L8 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmigd1Q9D7L8 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmigd1Q9D7L8 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmigd1Q9D7L8 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmigd1Q9D7L8 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Tmigd1Q9D7L8 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
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Tmigd1Q9D7L8 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Tmigd1Q9D7L8 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Tmigd1Q9D7L8 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Tmigd1Q9D7L8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Tmigd1Q9D7L8 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Tmigd1Q9D7L8 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Tmigd1Q9D7L8 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Tmigd1Q9D7L8 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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Tmigd1Q9D7L8 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmigd1Q9D7L8 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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