Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zbed3Q9D0L1 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms