Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Use1Q9CQ56 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Use1Q9CQ56 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Use1Q9CQ56 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Use1Q9CQ56 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Use1Q9CQ56 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Use1Q9CQ56 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Use1Q9CQ56 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Use1Q9CQ56 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Use1Q9CQ56 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Use1Q9CQ56 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Use1Q9CQ56 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Use1Q9CQ56 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Use1Q9CQ56 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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