Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup155Q99P88 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms