Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccdc115Q8VE99 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Ccdc115Q8VE99 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccdc115Q8VE99 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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