Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Tmem17Q8K0U3 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Tmem17Q8K0U3 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Tmem17Q8K0U3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Tmem17Q8K0U3 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmem17Q8K0U3 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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