Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rab11fip3Q8CHD8 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rab11fip3Q8CHD8 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rab11fip3Q8CHD8 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rab11fip3Q8CHD8 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms