Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp27Q8CEG8 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms