Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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