Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trak1Q6PD31 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trak1Q6PD31 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trak1Q6PD31 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trak1Q6PD31 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trak1Q6PD31 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trak1Q6PD31 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms