Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Arhgap20Q6IFT4 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms