Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Lrrn1Q61809 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
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Lrrn1Q61809 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Lrrn1Q61809 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Lrrn1Q61809 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Lrrn1Q61809 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Lrrn1Q61809 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Lrrn1Q61809 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms