Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Tm4sf1-201ENSMUST00000029376 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm37307-201ENSMUST00000193663 2621 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Nit1-201ENSMUST00000111289 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Sft2d1Q5SSN7 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Tmem74bos-202ENSMUST00000149319 2090 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms