Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ssbp4Q3U4B1 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ssbp4Q3U4B1 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms