Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc10Q3TLI0 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms