Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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Samd11Q1RNF8 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms