Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Msx2Q03358 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms