Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
SeleQ00690 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms