Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ptprn2P80560 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ptprn2P80560 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ptprn2P80560 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ptprn2P80560 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ptprn2P80560 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ptprn2P80560 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ptprn2P80560 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ptprn2P80560 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ptprn2P80560 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ptprn2P80560 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ptprn2P80560 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ptprn2P80560 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ptprn2P80560 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ptprn2P80560 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ptprn2P80560 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ptprn2P80560 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ptprn2P80560 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ptprn2P80560 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ptprn2P80560 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ptprn2P80560 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms