Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Acta1P68134 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms