Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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PtpreP49446 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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PtpreP49446 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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PtpreP49446 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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PtpreP49446 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PtpreP49446 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PtpreP49446 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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PtpreP49446 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PtpreP49446 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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