Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rab11bP46638 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rab11bP46638 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms