Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpl28P41105 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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