Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ggta1P23336 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ggta1P23336 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms