Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
TP20293 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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TP20293 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
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TP20293 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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TP20293 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TP20293 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TP20293 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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