Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Sdc1P18828 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms