Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hoxd4P10628 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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