Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Ccdc138-201ENSMUST00000036576 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 A630012P03Rik-202ENSMUST00000114854 1974 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Tm4sf1-201ENSMUST00000029376 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Sept6-202ENSMUST00000060474 3457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Svs1-201ENSMUST00000037696 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Zfp185-201ENSMUST00000114546 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm26772-201ENSMUST00000180466 3429 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm26815-201ENSMUST00000181200 3366 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm26511-201ENSMUST00000181400 1895 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Amt-201ENSMUST00000035230 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Rad51d-201ENSMUST00000018985 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gfap-202ENSMUST00000077902 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Dlgap4-202ENSMUST00000070782 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Tmprss13-201ENSMUST00000034597 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Atg7-201ENSMUST00000032457 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Sdc2-201ENSMUST00000022871 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ptpn20O55082 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms