Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20828J3KMI7 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20828J3KMI7 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms