Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tgm1Q9JLF6 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms