Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Syde1Q9DBZ9 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms