Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cldn22Q9D7U6 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 511.7 ms