Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Chmp3Q9CQ10 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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