Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b4Q99ME6 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms