Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rab11fip3Q8CHD8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Rab11fip3Q8CHD8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Rab11fip3Q8CHD8 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Rab11fip3Q8CHD8 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Rab11fip3Q8CHD8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rab11fip3Q8CHD8 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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