Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Usp27Q8CEG8 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Usp27Q8CEG8 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Usp27Q8CEG8 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Usp27Q8CEG8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Usp27Q8CEG8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp27Q8CEG8 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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