Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SynpoQ8CC35 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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