Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg4aQ8C9S8 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms