Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfsfm13Q8BXS2 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms