Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ttc29Q80VM3 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ttc29Q80VM3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ttc29Q80VM3 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ttc29Q80VM3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ttc29Q80VM3 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ttc29Q80VM3 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ttc29Q80VM3 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ttc29Q80VM3 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Ttc29Q80VM3 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Ttc29Q80VM3 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Ttc29Q80VM3 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ttc29Q80VM3 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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