Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Phf8Q80TJ7 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Phf8Q80TJ7 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Phf8Q80TJ7 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Phf8Q80TJ7 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Phf8Q80TJ7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Phf8Q80TJ7 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Phf8Q80TJ7 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Phf8Q80TJ7 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Phf8Q80TJ7 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms