Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Cir1-201ENSMUST00000058615 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 4930513N10Rik-202ENSMUST00000132616 490 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Cd8a-202ENSMUST00000172321 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Gm38250-202ENSMUST00000195108 462 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Nifk-201ENSMUST00000027626 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
BC061212Q6P8K3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms